Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATE1O95260 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATE1O95260 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATE1O95260 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATE1O95260 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATE1O95260 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATE1O95260 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATE1O95260 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATE1O95260 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATE1O95260 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATE1O95260 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATE1O95260 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATE1O95260 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATE1O95260 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATE1O95260 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATE1O95260 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATE1O95260 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATE1O95260 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATE1O95260 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATE1O95260 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATE1O95260 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATE1O95260 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATE1O95260 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATE1O95260 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATE1O95260 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATE1O95260 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATE1O95260 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATE1O95260 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATE1O95260 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATE1O95260 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATE1O95260 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATE1O95260 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATE1O95260 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATE1O95260 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATE1O95260 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATE1O95260 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATE1O95260 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATE1O95260 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATE1O95260 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATE1O95260 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATE1O95260 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATE1O95260 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATE1O95260 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATE1O95260 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATE1O95260 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATE1O95260 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATE1O95260 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATE1O95260 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATE1O95260 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATE1O95260 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATE1O95260 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATE1O95260 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATE1O95260 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATE1O95260 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATE1O95260 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATE1O95260 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATE1O95260 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATE1O95260 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATE1O95260 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATE1O95260 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATE1O95260 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATE1O95260 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATE1O95260 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATE1O95260 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATE1O95260 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATE1O95260 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATE1O95260 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATE1O95260 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATE1O95260 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATE1O95260 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATE1O95260 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATE1O95260 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATE1O95260 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATE1O95260 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATE1O95260 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATE1O95260 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATE1O95260 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATE1O95260 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATE1O95260 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATE1O95260 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATE1O95260 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATE1O95260 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATE1O95260 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATE1O95260 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATE1O95260 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATE1O95260 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATE1O95260 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATE1O95260 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATE1O95260 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATE1O95260 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATE1O95260 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATE1O95260 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATE1O95260 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATE1O95260 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATE1O95260 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATE1O95260 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATE1O95260 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATE1O95260 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATE1O95260 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATE1O95260 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms