Protein–RNA interactions for Protein: O95259

KCNH1, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 1, humanhuman

Predictions only

Length 989 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH1O95259 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH1O95259 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNH1O95259 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNH1O95259 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNH1O95259 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms