Protein–RNA interactions for Protein: O43390

HNRNPR, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPRO43390 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HNRNPRO43390 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HNRNPRO43390 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HNRNPRO43390 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HNRNPRO43390 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HNRNPRO43390 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNRNPRO43390 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HNRNPRO43390 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HNRNPRO43390 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HNRNPRO43390 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HNRNPRO43390 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HNRNPRO43390 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HNRNPRO43390 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HNRNPRO43390 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HNRNPRO43390 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms