Protein–RNA interactions for Protein: O15016

TRIM66, Tripartite motif-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM66O15016 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM66O15016 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM66O15016 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM66O15016 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM66O15016 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM66O15016 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms