Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F3O00716 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F3O00716 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F3O00716 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F3O00716 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F3O00716 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F3O00716 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F3O00716 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F3O00716 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F3O00716 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F3O00716 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F3O00716 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F3O00716 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F3O00716 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F3O00716 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F3O00716 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F3O00716 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F3O00716 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F3O00716 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F3O00716 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F3O00716 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F3O00716 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F3O00716 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F3O00716 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F3O00716 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F3O00716 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F3O00716 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F3O00716 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F3O00716 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F3O00716 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F3O00716 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F3O00716 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F3O00716 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F3O00716 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F3O00716 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F3O00716 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F3O00716 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F3O00716 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F3O00716 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F3O00716 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F3O00716 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F3O00716 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
E2F3O00716 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
E2F3O00716 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F3O00716 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F3O00716 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F3O00716 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F3O00716 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F3O00716 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F3O00716 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F3O00716 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F3O00716 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F3O00716 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F3O00716 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F3O00716 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F3O00716 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F3O00716 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F3O00716 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F3O00716 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F3O00716 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F3O00716 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F3O00716 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F3O00716 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F3O00716 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F3O00716 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F3O00716 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F3O00716 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F3O00716 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F3O00716 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F3O00716 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F3O00716 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F3O00716 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F3O00716 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F3O00716 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F3O00716 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F3O00716 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F3O00716 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F3O00716 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F3O00716 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F3O00716 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F3O00716 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F3O00716 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F3O00716 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F3O00716 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F3O00716 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F3O00716 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F3O00716 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F3O00716 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F3O00716 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F3O00716 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F3O00716 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F3O00716 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F3O00716 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F3O00716 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F3O00716 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F3O00716 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F3O00716 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F3O00716 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F3O00716 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F3O00716 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms