Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms