Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDR42E2A6NKP2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDR42E2A6NKP2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDR42E2A6NKP2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDR42E2A6NKP2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms