Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP5A6NIR3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AGAP5A6NIR3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP5A6NIR3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms