Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 HAP1-202ENST00000341193 3880 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-2Q9BYR5 FBXO38-202ENST00000340253 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 GUCY1B3-201ENST00000264424 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 AC084759.3-201ENST00000624468 3944 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 AL359075.2-201ENST00000354921 4998 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ARMC8-223ENST00000538260 4728 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 GPRASP2-201ENST00000332262 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 GFM1-210ENST00000486715 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 DCLK3-201ENST00000416516 5344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 PNMA8C-201ENST00000617053 4255 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 KAT7-202ENST00000424009 3469 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ITGBL1-205ENST00000545560 4808 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC90B-214ENST00000529689 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ADGRG1-216ENST00000562631 4042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 CAPN3-206ENST00000397163 3228 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 IL4R-203ENST00000543915 3539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGRP1-213ENST00000561180 2707 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPV3-211ENST00000616411 5742 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 OPCML-207ENST00000541867 6277 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 OPCML-208ENST00000612177 6250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ZMIZ2-205ENST00000433667 3800 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 GAREM1-201ENST00000269209 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 CBLL1-205ENST00000440859 4432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 C2orf49-201ENST00000258457 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 TSPAN18-201ENST00000340160 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 AP005131.6-201ENST00000587344 4215 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF623-202ENST00000501748 6759 ntAPPRIS P3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 SP1-201ENST00000327443 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 SYBU-202ENST00000399066 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ADIPOQ-202ENST00000444204 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 AC090197.1-202ENST00000519692 4374 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF41-201ENST00000345093 5596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP12-202ENST00000345770 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 C2CD5-201ENST00000333957 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 HPS5-203ENST00000396253 4725 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 AC008555.2-202ENST00000601776 5302 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 SCMH1-207ENST00000372597 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 HSPH1-209ENST00000630972 3570 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 VPS18-201ENST00000220509 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC22A11-201ENST00000301891 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 SCN10A-201ENST00000449082 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 CDHR4-202ENST00000412678 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 ASTN1-202ENST00000361833 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA0141-202ENST00000432126 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 LEP-201ENST00000308868 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-2Q9BYR5 BBS1-201ENST00000318312 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms