Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SBNO2Q9Y2G9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBNO2Q9Y2G9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms