Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VWC2Q2TAL6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms