Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 ROR2-206ENST00000546883 501 ntTSL 320.63■□□□□ 0.892e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.65■□□□□ 0.266e-8■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 TEX10-203ENST00000477648 4457 ntTSL 212.08□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.496e-8■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.073e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.273e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ANKLE2-211ENST00000545623 1288 ntTSL 312.31□□□□□ -0.443e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 ANKLE2-204ENST00000535036 741 ntTSL 510.41□□□□□ -0.743e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 STON2-201ENST00000267540 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.552e-6■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.667e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 DDB1-217ENST00000540166 3906 ntTSL 212.1□□□□□ -0.477e-7■■■■□ 23.1
HNRNPMP52272 EIF4G3-202ENST00000356916 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.28e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.762e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PCNT-205ENST00000480896 10485 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PTPRJ-206ENST00000534219 546 ntTSL 339.75■■■■□ 3.958e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PTPRJ-205ENST00000527952 626 ntTSL 538.89■■■■□ 3.828e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.018e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.928e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.518e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.098e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.464e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PDLIM1-202ENST00000477757 850 ntTSL 233.25■■■□□ 2.911e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.681e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.668e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 ZNF761-204ENST00000610928 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.448e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-215ENST00000570125 681 ntTSL 444.72■■■■■ 4.753e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.163e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.143e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-206ENST00000563815 1913 ntTSL 228.06■■■□□ 2.083e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.783e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-204ENST00000562586 578 ntTSL 225.62■■□□□ 1.693e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-214ENST00000569572 578 ntTSL 322.97■■□□□ 1.273e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-211ENST00000568117 521 ntTSL 322.62■■□□□ 1.213e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-210ENST00000567908 565 ntTSL 222.12■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-207ENST00000565287 556 ntTSL 321.61■■□□□ 1.053e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 UBAC2-201ENST00000355700 748 ntTSL 326.83■■□□□ 1.895e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.735e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.945e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 UBAC2-206ENST00000468067 968 ntTSL 219.2■□□□□ 0.665e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 UBAC2-207ENST00000473091 610 ntTSL 417.28■□□□□ 0.365e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.933e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 LINC01033-203ENST00000517934 306 ntTSL 21.91□□□□□ -2.13e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 STK24-202ENST00000376554 3602 ntTSL 514.55□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 ZNF516-205ENST00000617840 2326 ntTSL 1 (best)24.79■■□□□ 1.564e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 ZNF516-203ENST00000542818 346 ntTSL 215.42■□□□□ 0.064e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 BMPR1A-205ENST00000638429 5632 ntTSL 521.82■■□□□ 1.081e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CDK17-210ENST00000552262 566 ntTSL 316.58■□□□□ 0.245e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CDK17-211ENST00000552496 583 ntTSL 313□□□□□ -0.335e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CDK17-209ENST00000551816 626 ntTSL 43.92□□□□□ -1.785e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-8■■■■□ 23
HNRNPMP52272 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-8■■■■□ 23
HNRNPMP52272 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-8■■■■□ 23
HNRNPMP52272 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-8■■■■□ 23
HNRNPMP52272 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.281e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.51e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 STK24-205ENST00000444574 1590 ntTSL 1 (best)21.19■□□□□ 0.981e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)27.54■■■□□ 22e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 510.86□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.524e-8■■■■□ 23
HNRNPMP52272 SPEN-202ENST00000438066 1733 ntTSL 38.61□□□□□ -1.034e-8■■■■□ 23
HNRNPMP52272 SPEN-203ENST00000442985 891 ntTSL 57.75□□□□□ -1.174e-8■■■■□ 23
HNRNPMP52272 HUS1-205ENST00000436444 2121 ntTSL 216.36■□□□□ 0.216e-8■■■■□ 23
HNRNPMP52272 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CCDC85C-202ENST00000554877 543 ntTSL 419.64■□□□□ 0.738e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CCDC85C-205ENST00000556348 556 ntTSL 518.58■□□□□ 0.568e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CCDC85C-203ENST00000554996 619 ntTSL 416.38■□□□□ 0.218e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.478e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 USP10-208ENST00000563386 590 ntTSL 429.75■■■□□ 2.356e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 USP10-205ENST00000562743 888 ntTSL 229.51■■■□□ 2.316e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 USP10-203ENST00000562092 254 ntTSL 527.56■■■□□ 26e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 USP10-204ENST00000562283 569 ntTSL 426.7■■□□□ 1.866e-7■■■■□ 23
HNRNPMP52272 SEPT2-211ENST00000421717 818 ntTSL 428.38■■■□□ 2.135e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.195e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 SASH1-211ENST00000637729 875 ntTSL 219.14■□□□□ 0.655e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 SASH1-208ENST00000637029 571 ntTSL 413.97□□□□□ -0.175e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 SASH1-209ENST00000637469 523 ntTSL 411.21□□□□□ -0.615e-6■■■■□ 23
HNRNPMP52272 SEPT2-237ENST00000481500 756 ntTSL 210.8□□□□□ -0.685e-6■■■■□ 23
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 261.4 ms