RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570125.5

CARHSP1-215, Transcript of calcium regulated heat stable protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene CARHSP1, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARHSP1-215ENST00000570125 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.45■■■■■ 8.71
CARHSP1-215ENST00000570125 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.86■■■■■ 7.49
CARHSP1-215ENST00000570125 ABCC9O60706 1549 aa60.81■■■■■ 7.32
CARHSP1-215ENST00000570125 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.34■■■■■ 6.93
CARHSP1-215ENST00000570125 NACADO15069 1562 aa58.21■■■■■ 6.91
CARHSP1-215ENST00000570125 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.09■■■■■ 6.89
CARHSP1-215ENST00000570125 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.81■■■■■ 6.85
CARHSP1-215ENST00000570125 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.77■■■■■ 6.84
CARHSP1-215ENST00000570125 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.44■■■■■ 6.79
CARHSP1-215ENST00000570125 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.08■■■■■ 6.73
CARHSP1-215ENST00000570125 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.77■■■■■ 6.68
CARHSP1-215ENST00000570125 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.64■■■■■ 6.66
CARHSP1-215ENST00000570125 SCRIBQ14160 1630 aa56.45■■■■■ 6.63
CARHSP1-215ENST00000570125 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.07■■■■■ 6.57
CARHSP1-215ENST00000570125 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.96■■■■■ 6.55
CARHSP1-215ENST00000570125 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.14■■■■■ 6.42
CARHSP1-215ENST00000570125 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.99■■■■■ 6.39
CARHSP1-215ENST00000570125 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.65■■■■■ 6.34
CARHSP1-215ENST00000570125 SMARCA4P51532 1647 aa53.96■■■■■ 6.23
CARHSP1-215ENST00000570125 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.83■■■■■ 6.21
CARHSP1-215ENST00000570125 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.73■■■■■ 6.19
CARHSP1-215ENST00000570125 NCAPD3P42695 1498 aa53.72■■■■■ 6.19
CARHSP1-215ENST00000570125 SMARCA2P51531 1590 aa53.63■■■■■ 6.18
CARHSP1-215ENST00000570125 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.54■■■■■ 6.16
CARHSP1-215ENST00000570125 HMGXB3Q12766 1538 aa53.45■■■■■ 6.15
CARHSP1-215ENST00000570125 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.43■■■■■ 6.14
CARHSP1-215ENST00000570125 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.26■■■■■ 6.12
CARHSP1-215ENST00000570125 WIZO95785 1651 aa52.96■■■■■ 6.07
CARHSP1-215ENST00000570125 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.83■■■■■ 6.05
CARHSP1-215ENST00000570125 NESP48681 1621 aa52.55■■■■■ 6
CARHSP1-215ENST00000570125 ERCC6Q03468 1493 aa52.4■■■■■ 5.98
CARHSP1-215ENST00000570125 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.36■■■■■ 5.97
CARHSP1-215ENST00000570125 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.35■■■■■ 5.97
CARHSP1-215ENST00000570125 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.14■■■■■ 5.94
CARHSP1-215ENST00000570125 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.98■■■■■ 5.91
CARHSP1-215ENST00000570125 CUX2O14529 1486 aa51.95■■■■■ 5.91
CARHSP1-215ENST00000570125 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.93■■■■■ 5.9
CARHSP1-215ENST00000570125 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.83■■■■■ 5.89
CARHSP1-215ENST00000570125 CFTRP13569 1480 aa51.79■■■■■ 5.88
CARHSP1-215ENST00000570125 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.74■■■■■ 5.87
CARHSP1-215ENST00000570125 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.56■■■■■ 5.84
CARHSP1-215ENST00000570125 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.51■■■■■ 5.84
CARHSP1-215ENST00000570125 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.5■■■■■ 5.84
CARHSP1-215ENST00000570125 PRDM2Q13029 1718 aa51.38■■■■■ 5.82
CARHSP1-215ENST00000570125 WDR62O43379 1518 aa51.35■■■■■ 5.81
CARHSP1-215ENST00000570125 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.25■■■■■ 5.79
CARHSP1-215ENST00000570125 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.08■■■■■ 5.77
CARHSP1-215ENST00000570125 TOPBP1Q92547 1522 aa50.71■■■■■ 5.71
CARHSP1-215ENST00000570125 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.66■■■■■ 5.7
CARHSP1-215ENST00000570125 ABCC8Q09428 1581 aa50.64■■■■■ 5.7
CARHSP1-215ENST00000570125 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.63■■■■■ 5.7
CARHSP1-215ENST00000570125 IFT140Q96RY7 1462 aa50.44■■■■■ 5.66
CARHSP1-215ENST00000570125 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.27■■■■■ 5.64
CARHSP1-215ENST00000570125 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.27■■■■■ 5.64
CARHSP1-215ENST00000570125 CUX1P39880 1505 aa50.25■■■■■ 5.63
CARHSP1-215ENST00000570125 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.19■■■■■ 5.63
CARHSP1-215ENST00000570125 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.11■■■■■ 5.61
CARHSP1-215ENST00000570125 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.06■■■■■ 5.6
CARHSP1-215ENST00000570125 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
CARHSP1-215ENST00000570125 SOGA1O94964 1423 aa50.03■■■■■ 5.6
CARHSP1-215ENST00000570125 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.94■■■■■ 5.587e-8■■■■■ 41.3
CARHSP1-215ENST00000570125 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.79■■■■■ 5.56
CARHSP1-215ENST00000570125 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.79■■■■■ 5.56
CARHSP1-215ENST00000570125 WDR97A6NE52 1622 aa49.74■■■■■ 5.55
CARHSP1-215ENST00000570125 TOP2BQ02880 1626 aa49.73■■■■■ 5.55
CARHSP1-215ENST00000570125 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.73■■■■■ 5.55
CARHSP1-215ENST00000570125 SYNJ1O43426 1573 aa49.72■■■■■ 5.55
CARHSP1-215ENST00000570125 OSCARQ8IYS5 282 aa49.72■■■■■ 5.55
CARHSP1-215ENST00000570125 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.6■■■■■ 5.53
CARHSP1-215ENST00000570125 GRIN2BQ13224 1484 aa49.48■■■■■ 5.51
CARHSP1-215ENST00000570125 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.48■■■■■ 5.51
CARHSP1-215ENST00000570125 CHD1O14646 1710 aa49.48■■■■■ 5.51
CARHSP1-215ENST00000570125 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.46■■■■■ 5.51
CARHSP1-215ENST00000570125 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.45■■■■■ 5.51
CARHSP1-215ENST00000570125 PBRM1Q86U86 1689 aa49.39■■■■■ 5.5
CARHSP1-215ENST00000570125 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.37■■■■■ 5.49
CARHSP1-215ENST00000570125 FBLN2P98095 1184 aa49.35■■■■■ 5.49
CARHSP1-215ENST00000570125 SYNJ2O15056 1496 aa49.2■■■■■ 5.47
CARHSP1-215ENST00000570125 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.17■■■■■ 5.46
CARHSP1-215ENST00000570125 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.01■■■■■ 5.44
CARHSP1-215ENST00000570125 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.01■■■■■ 5.44
CARHSP1-215ENST00000570125 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.01■■■■■ 5.44
CARHSP1-215ENST00000570125 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.99■■■■■ 5.43
CARHSP1-215ENST00000570125 ADAMTS12P58397 1594 aa48.99■■■■■ 5.43
CARHSP1-215ENST00000570125 ARHGEF11O15085 1522 aa48.97■■■■■ 5.43
CARHSP1-215ENST00000570125 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.94■■■■■ 5.43
CARHSP1-215ENST00000570125 TRIM41Q8WV44 630 aa48.9■■■■■ 5.42
CARHSP1-215ENST00000570125 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.87■■■■■ 5.41
CARHSP1-215ENST00000570125 GRIN2AQ12879 1464 aa48.86■■■■■ 5.41
CARHSP1-215ENST00000570125 KIF27Q86VH2 1401 aa48.75■■■■■ 5.4
CARHSP1-215ENST00000570125 NUP160Q12769 1436 aa48.66■■■■■ 5.38
CARHSP1-215ENST00000570125 CEP170Q5SW79 1584 aa48.65■■■■■ 5.38
CARHSP1-215ENST00000570125 IGF1RP08069 1367 aa48.62■■■■■ 5.37
CARHSP1-215ENST00000570125 ARAP1Q96P48 1450 aa48.57■■■■■ 5.37
CARHSP1-215ENST00000570125 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.5■■■■■ 5.35
CARHSP1-215ENST00000570125 CUL7Q14999 1698 aa48.5■■■■■ 5.35
CARHSP1-215ENST00000570125 SHROOM2Q13796 1616 aa48.32■■■■■ 5.33
CARHSP1-215ENST00000570125 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.31■■■■■ 5.32
CARHSP1-215ENST00000570125 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.29■■■■■ 5.32
CARHSP1-215ENST00000570125 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.26■■■■■ 5.32
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