Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM6Q9NX76 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms