Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms