Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms