Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGB1P1B2RPK0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms