Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt28.86■■■□□ 2.211e-38■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 CEP104-204ENST00000438539 683 ntTSL 521.9■■□□□ 1.16e-10■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 CEP104-207ENST00000461667 926 ntTSL 520.94■□□□□ 0.946e-10■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.446e-10■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 UBC-203ENST00000535859 582 ntTSL 221.5■■□□□ 1.038e-16■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.544e-7■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.54e-7■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 GNPTG-205ENST00000527168 1317 ntTSL 535.65■■■■□ 3.38e-7■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 GNPTG-208ENST00000529957 922 ntTSL 534.67■■■■□ 3.148e-7■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 GNPTG-209ENST00000534197 420 ntTSL 334.67■■■■□ 3.148e-7■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.128e-7■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 GNPTG-206ENST00000527876 550 ntTSL 434.4■■■■□ 3.18e-7■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 GNPTG-207ENST00000529110 552 ntTSL 233.79■■■■□ 38e-7■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 GNPTG-202ENST00000526820 572 ntTSL 330.05■■■□□ 2.48e-7■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 ARHGEF16-207ENST00000485984 2340 ntTSL 225.15■■□□□ 1.623e-6■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.333e-6■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.063e-6■■■□□ 16.1
DROSHAQ9NRR4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.261e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 SURF4-201ENST00000371982 553 ntTSL 323.56■■□□□ 1.361e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.281e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.181e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.181e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.11e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.951e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 SURF4-205ENST00000467910 693 ntTSL 520.12■□□□□ 0.811e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.571e-10■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.031e-10■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 PDS5A-205ENST00000506262 559 ntTSL 320.59■□□□□ 0.891e-10■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.811e-10■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.811e-10■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-10■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 TIMP1-203ENST00000441738 341 ntTSL 512.81□□□□□ -0.361e-10■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 UBTF-214ENST00000537550 1085 ntTSL 236.51■■■■□ 3.432e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.582e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.012e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.622e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)24.45■■□□□ 1.56e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 523.9■■□□□ 1.426e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.142e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 221.65■■□□□ 1.066e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.996e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.776e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.776e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.592e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.512e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ARID3A-204ENST00000585895 377 ntTSL 239.85■■■■□ 3.974e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.432e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.832e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 STMN1-207ENST00000465604 2947 ntTSL 1 (best)6.38□□□□□ -1.392e-6■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 MICALL2-209ENST00000479007 1855 ntTSL 229.41■■■□□ 2.33e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 MICALL2-205ENST00000467783 639 ntTSL 327.29■■□□□ 1.963e-7■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ARL5A-205ENST00000487723 696 ntTSL 333.8■■■■□ 38e-9■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.698e-9■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ARL5A-204ENST00000458140 1076 ntTSL 531.76■■■□□ 2.678e-9■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.268e-9■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 AC068547.1-203ENST00000637559 1373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.088e-9■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 AC068547.1-202ENST00000637224 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.87□□□□□ -0.518e-9■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 AC068547.1-201ENST00000636024 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.46□□□□□ -0.98e-9■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 ARL5A-203ENST00000446896 1268 ntTSL 28.47□□□□□ -1.058e-9■■■□□ 16
DROSHAQ9NRR4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.093e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 OPLAH-201ENST00000527993 635 ntTSL 534.2■■■■□ 3.071e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 OPLAH-202ENST00000531027 500 ntTSL 222.1■■□□□ 1.131e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 PPP2R3B-208ENST00000479438 1090 ntTSL 232.32■■■□□ 2.772e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.21e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 PRSS21-203ENST00000570594 809 ntTSL 329.35■■■□□ 2.291e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 PRSS21-207ENST00000574813 873 ntTSL 328.85■■■□□ 2.211e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.971e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 PRSS21-204ENST00000570629 626 ntTSL 219.05■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 EPC2-205ENST00000457184 724 ntTSL 529.53■■■□□ 2.328e-8■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 PSMA5-203ENST00000484563 1503 ntTSL 225.41■■□□□ 1.662e-10■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.492e-10■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 MIDN-205ENST00000591302 523 ntTSL 229.07■■■□□ 2.241e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 KHNYN-203ENST00000554268 760 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.256e-8■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 MAEA-220ENST00000515766 3136 ntTSL 221.18■□□□□ 0.985e-14■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)30.53■■■□□ 2.487e-7■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 PPP1R12C-204ENST00000586992 4141 nt19.52■□□□□ 0.727e-7■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 ATP5F1-206ENST00000493119 716 ntTSL 323.49■■□□□ 1.351e-7■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.761e-7■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 ATP5F1-205ENST00000483994 678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.241e-7■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 ATP5F1-201ENST00000369721 1040 ntTSL 212.23□□□□□ -0.451e-7■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 ATP5F1-204ENST00000468818 859 ntTSL 37.01□□□□□ -1.291e-7■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 428.81■■■□□ 2.21e-6■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 TUBA1C-208ENST00000552125 575 ntTSL 416.72■□□□□ 0.274e-8■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 TUBA1C-206ENST00000549818 536 ntTSL 414.55□□□□□ -0.084e-8■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 TUBA1C-204ENST00000549183 696 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.114e-8■■■□□ 15.9
DROSHAQ9NRR4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.712e-12■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.252e-12■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.842e-12■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.532e-12■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -02e-12■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.98e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 531.27■■■□□ 2.63e-10■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 526.83■■□□□ 1.895e-6■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 524.57■■□□□ 1.525e-6■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 324.57■■□□□ 1.525e-6■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-214ENST00000481319 616 ntTSL 322.56■■□□□ 1.25e-6■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.095e-6■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 318.01■□□□□ 0.474e-6■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.095e-6■■■□□ 15.8
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