Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms