Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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COPS9Q8WXC6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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COPS9Q8WXC6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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COPS9Q8WXC6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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