RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397054.7

P3H1-204, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene P3H1, Length 2,705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-204ENST00000397054 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.54■■■■□ 3.76
P3H1-204ENST00000397054 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.28■■■□□ 2.92
P3H1-204ENST00000397054 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
P3H1-204ENST00000397054 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
P3H1-204ENST00000397054 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.52■■■□□ 2.8
P3H1-204ENST00000397054 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.31■■■□□ 2.76
P3H1-204ENST00000397054 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.62■■■□□ 2.65
P3H1-204ENST00000397054 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.6■■■□□ 2.65
P3H1-204ENST00000397054 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.41■■■□□ 2.62
P3H1-204ENST00000397054 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.86■■■□□ 2.53
P3H1-204ENST00000397054 SCRIBQ14160 1630 aa30.82■■■□□ 2.52
P3H1-204ENST00000397054 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.8■■■□□ 2.52
P3H1-204ENST00000397054 HRCP23327 699 aa30.76■■■□□ 2.52
P3H1-204ENST00000397054 ABCC9O60706 1549 aa30.73■■■□□ 2.51
P3H1-204ENST00000397054 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
P3H1-204ENST00000397054 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
P3H1-204ENST00000397054 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.33■■■□□ 2.45
P3H1-204ENST00000397054 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.25■■■□□ 2.43
P3H1-204ENST00000397054 TRIM41Q8WV44 630 aa30.23■■■□□ 2.43
P3H1-204ENST00000397054 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
P3H1-204ENST00000397054 NACADO15069 1562 aa30.12■■■□□ 2.41
P3H1-204ENST00000397054 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.11■■■□□ 2.41
P3H1-204ENST00000397054 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.08■■■□□ 2.41
P3H1-204ENST00000397054 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
P3H1-204ENST00000397054 WIZO95785 1651 aa29.91■■■□□ 2.38
P3H1-204ENST00000397054 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
P3H1-204ENST00000397054 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
P3H1-204ENST00000397054 ABCC8Q09428 1581 aa29.34■■■□□ 2.29
P3H1-204ENST00000397054 SMARCA4P51532 1647 aa29.32■■■□□ 2.28
P3H1-204ENST00000397054 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.31■■■□□ 2.28
P3H1-204ENST00000397054 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.31■■■□□ 2.28
P3H1-204ENST00000397054 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.282e-6■□□□□ 11
P3H1-204ENST00000397054 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
P3H1-204ENST00000397054 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
P3H1-204ENST00000397054 SMARCA2P51531 1590 aa29.21■■■□□ 2.27
P3H1-204ENST00000397054 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
P3H1-204ENST00000397054 SOGA1O94964 1423 aa29.1■■■□□ 2.25
P3H1-204ENST00000397054 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
P3H1-204ENST00000397054 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29■■■□□ 2.23
P3H1-204ENST00000397054 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.99■■■□□ 2.23
P3H1-204ENST00000397054 CEP162Q5TB80 1403 aa28.89■■■□□ 2.22
P3H1-204ENST00000397054 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.85■■■□□ 2.21
P3H1-204ENST00000397054 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
P3H1-204ENST00000397054 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
P3H1-204ENST00000397054 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.75■■■□□ 2.19
P3H1-204ENST00000397054 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
P3H1-204ENST00000397054 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.63■■■□□ 2.17
P3H1-204ENST00000397054 EEA1Q15075 1411 aa28.62■■■□□ 2.17
P3H1-204ENST00000397054 SYNJ1O43426 1573 aa28.61■■■□□ 2.17
P3H1-204ENST00000397054 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.61■■■□□ 2.17
P3H1-204ENST00000397054 GOLGA3Q08378 1498 aa28.57■■■□□ 2.16
P3H1-204ENST00000397054 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
P3H1-204ENST00000397054 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
P3H1-204ENST00000397054 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
P3H1-204ENST00000397054 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.38■■■□□ 2.13
P3H1-204ENST00000397054 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.33■■■□□ 2.13
P3H1-204ENST00000397054 CLIP1P30622 1438 aa28.33■■■□□ 2.12
P3H1-204ENST00000397054 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
P3H1-204ENST00000397054 KIF21BO75037 1637 aa28.29■■■□□ 2.12
P3H1-204ENST00000397054 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
P3H1-204ENST00000397054 NEUROD1Q13562 356 aa28.17■■■□□ 2.1
P3H1-204ENST00000397054 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.16■■■□□ 2.1
P3H1-204ENST00000397054 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
P3H1-204ENST00000397054 TOP2BQ02880 1626 aa28.13■■■□□ 2.09
P3H1-204ENST00000397054 APLP2Q06481 763 aa28.06■■■□□ 2.08
P3H1-204ENST00000397054 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.98■■■□□ 2.07
P3H1-204ENST00000397054 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
P3H1-204ENST00000397054 CUX1P39880 1505 aa27.97■■■□□ 2.07
P3H1-204ENST00000397054 NCAPD3P42695 1498 aa27.96■■■□□ 2.07
P3H1-204ENST00000397054 PRXQ9BXM0 1461 aa27.93■■■□□ 2.06
P3H1-204ENST00000397054 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
P3H1-204ENST00000397054 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
P3H1-204ENST00000397054 HMGXB3Q12766 1538 aa27.88■■■□□ 2.05
P3H1-204ENST00000397054 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.88■■■□□ 2.05
P3H1-204ENST00000397054 ARAP1Q96P48 1450 aa27.87■■■□□ 2.05
P3H1-204ENST00000397054 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
P3H1-204ENST00000397054 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.81■■■□□ 2.04
P3H1-204ENST00000397054 CFTRP13569 1480 aa27.79■■■□□ 2.04
P3H1-204ENST00000397054 KIF27Q86VH2 1401 aa27.77■■■□□ 2.04
P3H1-204ENST00000397054 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.04
P3H1-204ENST00000397054 MIER1Q8N108 512 aa27.73■■■□□ 2.03
P3H1-204ENST00000397054 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.63■■■□□ 2.01
P3H1-204ENST00000397054 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
P3H1-204ENST00000397054 CUX2O14529 1486 aa27.6■■■□□ 2.01
P3H1-204ENST00000397054 ITGAEP38570 1179 aa27.6■■■□□ 2.01
P3H1-204ENST00000397054 IGF1RP08069 1367 aa27.57■■■□□ 2
P3H1-204ENST00000397054 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.51■■□□□ 1.99
P3H1-204ENST00000397054 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
P3H1-204ENST00000397054 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.46■■□□□ 1.99
P3H1-204ENST00000397054 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.43■■□□□ 1.98
P3H1-204ENST00000397054 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.43■■□□□ 1.98
P3H1-204ENST00000397054 P3H3Q8IVL6 736 aa27.43■■□□□ 1.98
P3H1-204ENST00000397054 PRDM2Q13029 1718 aa27.37■■□□□ 1.97
P3H1-204ENST00000397054 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.34■■□□□ 1.97
P3H1-204ENST00000397054 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
P3H1-204ENST00000397054 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.31■■□□□ 1.96
P3H1-204ENST00000397054 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.28■■□□□ 1.96
P3H1-204ENST00000397054 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.26■■□□□ 1.96
P3H1-204ENST00000397054 TIAM1Q13009 1591 aa27.25■■□□□ 1.95
P3H1-204ENST00000397054 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.1 ms