Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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