RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627576.2

CORO1B-210, Transcript of coronin 1B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CORO1B, Length 960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Lamellipodium, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO1B-210ENST00000627576 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.07■■■■■ 5.29
CORO1B-210ENST00000627576 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.85■■■■■ 4.45
CORO1B-210ENST00000627576 ABCC9O60706 1549 aa42.41■■■■■ 4.38
CORO1B-210ENST00000627576 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.54■■■■■ 4.08
CORO1B-210ENST00000627576 NACADO15069 1562 aa40.37■■■■■ 4.05
CORO1B-210ENST00000627576 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.2■■■■■ 4.03
CORO1B-210ENST00000627576 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
CORO1B-210ENST00000627576 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.96■■■■□ 3.99
CORO1B-210ENST00000627576 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.75■■■■□ 3.95
CORO1B-210ENST00000627576 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.75■■■■□ 3.95
CORO1B-210ENST00000627576 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.52■■■■□ 3.92
CORO1B-210ENST00000627576 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.45■■■■□ 3.91
CORO1B-210ENST00000627576 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.44■■■■□ 3.9
CORO1B-210ENST00000627576 SCRIBQ14160 1630 aa39.09■■■■□ 3.85
CORO1B-210ENST00000627576 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.86■■■■□ 3.81
CORO1B-210ENST00000627576 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
CORO1B-210ENST00000627576 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.37■■■■□ 3.73
CORO1B-210ENST00000627576 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.15■■■■□ 3.7
CORO1B-210ENST00000627576 SMARCA4P51532 1647 aa37.35■■■■□ 3.57
CORO1B-210ENST00000627576 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
CORO1B-210ENST00000627576 NCAPD3P42695 1498 aa37.26■■■■□ 3.56
CORO1B-210ENST00000627576 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.22■■■■□ 3.55
CORO1B-210ENST00000627576 SMARCA2P51531 1590 aa37.12■■■■□ 3.53
CORO1B-210ENST00000627576 HMGXB3Q12766 1538 aa37.05■■■■□ 3.52
CORO1B-210ENST00000627576 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.05■■■■□ 3.52
CORO1B-210ENST00000627576 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.96■■■■□ 3.51
CORO1B-210ENST00000627576 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
CORO1B-210ENST00000627576 WIZO95785 1651 aa36.66■■■■□ 3.46
CORO1B-210ENST00000627576 NESP48681 1621 aa36.59■■■■□ 3.45
CORO1B-210ENST00000627576 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CORO1B-210ENST00000627576 ERCC6Q03468 1493 aa36.54■■■■□ 3.44
CORO1B-210ENST00000627576 CUX2O14529 1486 aa36.37■■■■□ 3.41
CORO1B-210ENST00000627576 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.36■■■■□ 3.41
CORO1B-210ENST00000627576 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
CORO1B-210ENST00000627576 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
CORO1B-210ENST00000627576 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.16■■■■□ 3.38
CORO1B-210ENST00000627576 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.13■■■■□ 3.37
CORO1B-210ENST00000627576 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.08■■■■□ 3.37
CORO1B-210ENST00000627576 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.85■■■■□ 3.33
CORO1B-210ENST00000627576 CFTRP13569 1480 aa35.84■■■■□ 3.33
CORO1B-210ENST00000627576 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.81■■■■□ 3.32
CORO1B-210ENST00000627576 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.8■■■■□ 3.32
CORO1B-210ENST00000627576 WDR62O43379 1518 aa35.74■■■■□ 3.31
CORO1B-210ENST00000627576 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.73■■■■□ 3.31
CORO1B-210ENST00000627576 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.73■■■■□ 3.31
CORO1B-210ENST00000627576 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
CORO1B-210ENST00000627576 PRDM2Q13029 1718 aa35.58■■■■□ 3.29
CORO1B-210ENST00000627576 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CORO1B-210ENST00000627576 TOPBP1Q92547 1522 aa35.13■■■■□ 3.21
CORO1B-210ENST00000627576 ABCC8Q09428 1581 aa35.04■■■■□ 3.2
CORO1B-210ENST00000627576 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.04■■■■□ 3.2
CORO1B-210ENST00000627576 IFT140Q96RY7 1462 aa35■■■■□ 3.19
CORO1B-210ENST00000627576 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
CORO1B-210ENST00000627576 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
CORO1B-210ENST00000627576 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
CORO1B-210ENST00000627576 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
CORO1B-210ENST00000627576 CUX1P39880 1505 aa34.77■■■■□ 3.16
CORO1B-210ENST00000627576 OSCARQ8IYS5 282 aa34.7■■■■□ 3.15
CORO1B-210ENST00000627576 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.68■■■■□ 3.14
CORO1B-210ENST00000627576 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.66■■■■□ 3.14
CORO1B-210ENST00000627576 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.65■■■■□ 3.14
CORO1B-210ENST00000627576 SOGA1O94964 1423 aa34.6■■■■□ 3.13
CORO1B-210ENST00000627576 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.52■■■■□ 3.12
CORO1B-210ENST00000627576 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
CORO1B-210ENST00000627576 CHD1O14646 1710 aa34.47■■■■□ 3.11
CORO1B-210ENST00000627576 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.46■■■■□ 3.11
CORO1B-210ENST00000627576 SYNJ1O43426 1573 aa34.45■■■■□ 3.11
CORO1B-210ENST00000627576 WDR97A6NE52 1622 aa34.45■■■■□ 3.11
CORO1B-210ENST00000627576 TOP2BQ02880 1626 aa34.45■■■■□ 3.11
CORO1B-210ENST00000627576 TRIM41Q8WV44 630 aa34.41■■■■□ 3.1
CORO1B-210ENST00000627576 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.33■■■■□ 3.09
CORO1B-210ENST00000627576 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.33■■■■□ 3.09
CORO1B-210ENST00000627576 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.33■■■■□ 3.09
CORO1B-210ENST00000627576 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.33■■■■□ 3.09
CORO1B-210ENST00000627576 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.32■■■■□ 3.08
CORO1B-210ENST00000627576 GRIN2BQ13224 1484 aa34.26■■■■□ 3.07
CORO1B-210ENST00000627576 ARHGEF11O15085 1522 aa34.25■■■■□ 3.07
CORO1B-210ENST00000627576 FBLN2P98095 1184 aa34.24■■■■□ 3.07
CORO1B-210ENST00000627576 PBRM1Q86U86 1689 aa34.23■■■■□ 3.07
CORO1B-210ENST00000627576 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CORO1B-210ENST00000627576 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.22■■■■□ 3.07
CORO1B-210ENST00000627576 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.22■■■■□ 3.07
CORO1B-210ENST00000627576 SYNJ2O15056 1496 aa34.11■■■■□ 3.05
CORO1B-210ENST00000627576 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.08■■■■□ 3.05
CORO1B-210ENST00000627576 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CORO1B-210ENST00000627576 ARAP1Q96P48 1450 aa33.96■■■■□ 3.03
CORO1B-210ENST00000627576 ADAMTS12P58397 1594 aa33.93■■■■□ 3.02
CORO1B-210ENST00000627576 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.92■■■■□ 3.02
CORO1B-210ENST00000627576 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.88■■■■□ 3.01
CORO1B-210ENST00000627576 GRIN2AQ12879 1464 aa33.85■■■■□ 3.01
CORO1B-210ENST00000627576 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.81■■■■□ 3
CORO1B-210ENST00000627576 KIF27Q86VH2 1401 aa33.81■■■■□ 3
CORO1B-210ENST00000627576 CEP170Q5SW79 1584 aa33.75■■■□□ 2.99
CORO1B-210ENST00000627576 NUP160Q12769 1436 aa33.73■■■□□ 2.99
CORO1B-210ENST00000627576 CUL7Q14999 1698 aa33.63■■■□□ 2.97
CORO1B-210ENST00000627576 IGF1RP08069 1367 aa33.62■■■□□ 2.97
CORO1B-210ENST00000627576 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.6■■■□□ 2.97
CORO1B-210ENST00000627576 SHROOM2Q13796 1616 aa33.57■■■□□ 2.97
CORO1B-210ENST00000627576 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.45■■■□□ 2.94
CORO1B-210ENST00000627576 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.44■■■□□ 2.94
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