Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT10P13645 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT10P13645 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT10P13645 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT10P13645 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT10P13645 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT10P13645 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
KRT10P13645 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT10P13645 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms