RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599794.5

TIMM50-213, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TIMM50, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-213ENST00000599794 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.06■■■■■ 5.6
TIMM50-213ENST00000599794 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.53■■■■■ 4.72
TIMM50-213ENST00000599794 ABCC9O60706 1549 aa44.19■■■■■ 4.66
TIMM50-213ENST00000599794 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.15■■■■■ 4.34
TIMM50-213ENST00000599794 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.05■■■■■ 4.32
TIMM50-213ENST00000599794 NACADO15069 1562 aa42.02■■■■■ 4.32
TIMM50-213ENST00000599794 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.64■■■■■ 4.26
TIMM50-213ENST00000599794 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
TIMM50-213ENST00000599794 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.33■■■■■ 4.21
TIMM50-213ENST00000599794 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.33■■■■■ 4.21
TIMM50-213ENST00000599794 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.28■■■■■ 4.2
TIMM50-213ENST00000599794 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.2■■■■■ 4.19
TIMM50-213ENST00000599794 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.09■■■■■ 4.17
TIMM50-213ENST00000599794 SCRIBQ14160 1630 aa40.72■■■■■ 4.11
TIMM50-213ENST00000599794 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.36■■■■■ 4.05
TIMM50-213ENST00000599794 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
TIMM50-213ENST00000599794 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.9■■■■□ 3.98
TIMM50-213ENST00000599794 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.71■■■■□ 3.95
TIMM50-213ENST00000599794 SMARCA4P51532 1647 aa38.89■■■■□ 3.82
TIMM50-213ENST00000599794 NCAPD3P42695 1498 aa38.89■■■■□ 3.82
TIMM50-213ENST00000599794 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.86■■■■□ 3.81
TIMM50-213ENST00000599794 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
TIMM50-213ENST00000599794 SMARCA2P51531 1590 aa38.65■■■■□ 3.78
TIMM50-213ENST00000599794 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.65■■■■□ 3.78
TIMM50-213ENST00000599794 HMGXB3Q12766 1538 aa38.55■■■■□ 3.76
TIMM50-213ENST00000599794 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.52■■■■□ 3.76
TIMM50-213ENST00000599794 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
TIMM50-213ENST00000599794 NESP48681 1621 aa38.18■■■■□ 3.7
TIMM50-213ENST00000599794 WIZO95785 1651 aa38.17■■■■□ 3.7
TIMM50-213ENST00000599794 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
TIMM50-213ENST00000599794 ERCC6Q03468 1493 aa37.98■■■■□ 3.67
TIMM50-213ENST00000599794 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.81■■■■□ 3.64
TIMM50-213ENST00000599794 CUX2O14529 1486 aa37.75■■■■□ 3.63
TIMM50-213ENST00000599794 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.73■■■■□ 3.63
TIMM50-213ENST00000599794 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
TIMM50-213ENST00000599794 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.61■■■■□ 3.61
TIMM50-213ENST00000599794 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.57■■■■□ 3.61
TIMM50-213ENST00000599794 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
TIMM50-213ENST00000599794 CFTRP13569 1480 aa37.42■■■■□ 3.58
TIMM50-213ENST00000599794 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.33■■■■□ 3.57
TIMM50-213ENST00000599794 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.28■■■■□ 3.56
TIMM50-213ENST00000599794 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.27■■■■□ 3.56
TIMM50-213ENST00000599794 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.26■■■■□ 3.56
TIMM50-213ENST00000599794 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.2■■■■□ 3.54
TIMM50-213ENST00000599794 WDR62O43379 1518 aa37.16■■■■□ 3.54
TIMM50-213ENST00000599794 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
TIMM50-213ENST00000599794 PRDM2Q13029 1718 aa36.9■■■■□ 3.5
TIMM50-213ENST00000599794 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
TIMM50-213ENST00000599794 TOPBP1Q92547 1522 aa36.64■■■■□ 3.46
TIMM50-213ENST00000599794 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.49■■■■□ 3.43
TIMM50-213ENST00000599794 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
TIMM50-213ENST00000599794 ABCC8Q09428 1581 aa36.47■■■■□ 3.43
TIMM50-213ENST00000599794 IFT140Q96RY7 1462 aa36.45■■■■□ 3.43
TIMM50-213ENST00000599794 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.41
TIMM50-213ENST00000599794 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
TIMM50-213ENST00000599794 CUX1P39880 1505 aa36.25■■■■□ 3.39
TIMM50-213ENST00000599794 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.24■■■■□ 3.39
TIMM50-213ENST00000599794 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.21■■■■□ 3.393e-7■■■■□ 23.2
TIMM50-213ENST00000599794 OSCARQ8IYS5 282 aa36.2■■■■□ 3.39
TIMM50-213ENST00000599794 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
TIMM50-213ENST00000599794 SOGA1O94964 1423 aa36.16■■■■□ 3.38
TIMM50-213ENST00000599794 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.15■■■■□ 3.38
TIMM50-213ENST00000599794 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
TIMM50-213ENST00000599794 TRIM41Q8WV44 630 aa35.81■■■■□ 3.32
TIMM50-213ENST00000599794 WDR97A6NE52 1622 aa35.81■■■■□ 3.32
TIMM50-213ENST00000599794 FBLN2P98095 1184 aa35.79■■■■□ 3.32
TIMM50-213ENST00000599794 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.79■■■■□ 3.32
TIMM50-213ENST00000599794 CHD1O14646 1710 aa35.79■■■■□ 3.32
TIMM50-213ENST00000599794 SYNJ1O43426 1573 aa35.78■■■■□ 3.32
TIMM50-213ENST00000599794 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.78■■■■□ 3.32
TIMM50-213ENST00000599794 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.76■■■■□ 3.31
TIMM50-213ENST00000599794 TOP2BQ02880 1626 aa35.74■■■■□ 3.31
TIMM50-213ENST00000599794 GRIN2BQ13224 1484 aa35.73■■■■□ 3.31
TIMM50-213ENST00000599794 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.72■■■■□ 3.31
TIMM50-213ENST00000599794 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.69■■■■□ 3.3
TIMM50-213ENST00000599794 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.65■■■■□ 3.3
TIMM50-213ENST00000599794 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.65■■■■□ 3.3
TIMM50-213ENST00000599794 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.65■■■■□ 3.3
TIMM50-213ENST00000599794 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
TIMM50-213ENST00000599794 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.64■■■■□ 3.3
TIMM50-213ENST00000599794 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
TIMM50-213ENST00000599794 ARHGEF11O15085 1522 aa35.6■■■■□ 3.29
TIMM50-213ENST00000599794 PBRM1Q86U86 1689 aa35.56■■■■□ 3.28
TIMM50-213ENST00000599794 SYNJ2O15056 1496 aa35.55■■■■□ 3.28
TIMM50-213ENST00000599794 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.46■■■■□ 3.27
TIMM50-213ENST00000599794 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.37■■■■□ 3.25
TIMM50-213ENST00000599794 ARAP1Q96P48 1450 aa35.34■■■■□ 3.25
TIMM50-213ENST00000599794 ADAMTS12P58397 1594 aa35.3■■■■□ 3.24
TIMM50-213ENST00000599794 GRIN2AQ12879 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
TIMM50-213ENST00000599794 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.27■■■■□ 3.24
TIMM50-213ENST00000599794 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.25■■■■□ 3.23
TIMM50-213ENST00000599794 NUP160Q12769 1436 aa35.18■■■■□ 3.22
TIMM50-213ENST00000599794 CEP170Q5SW79 1584 aa35.17■■■■□ 3.22
TIMM50-213ENST00000599794 IGF1RP08069 1367 aa35.12■■■■□ 3.21
TIMM50-213ENST00000599794 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.05■■■■□ 3.2
TIMM50-213ENST00000599794 KIF27Q86VH2 1401 aa35.03■■■■□ 3.2
TIMM50-213ENST00000599794 SHROOM2Q13796 1616 aa34.93■■■■□ 3.18
TIMM50-213ENST00000599794 JPH4Q96JJ6 628 aa34.86■■■■□ 3.17
TIMM50-213ENST00000599794 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.81■■■■□ 3.16
TIMM50-213ENST00000599794 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.81■■■■□ 3.16
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