Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LTAP01374 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LTAP01374 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTAP01374 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTAP01374 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTAP01374 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTAP01374 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTAP01374 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTAP01374 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTAP01374 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTAP01374 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTAP01374 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTAP01374 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTAP01374 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTAP01374 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTAP01374 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTAP01374 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTAP01374 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTAP01374 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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LTAP01374 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTAP01374 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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