Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTAP01374 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTAP01374 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTAP01374 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTAP01374 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTAP01374 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTAP01374 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LTAP01374 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTAP01374 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTAP01374 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTAP01374 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTAP01374 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTAP01374 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTAP01374 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTAP01374 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTAP01374 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTAP01374 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LTAP01374 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTAP01374 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTAP01374 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTAP01374 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTAP01374 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTAP01374 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTAP01374 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTAP01374 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTAP01374 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTAP01374 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTAP01374 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTAP01374 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTAP01374 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTAP01374 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTAP01374 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTAP01374 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTAP01374 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTAP01374 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTAP01374 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTAP01374 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTAP01374 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTAP01374 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTAP01374 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTAP01374 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTAP01374 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTAP01374 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTAP01374 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTAP01374 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTAP01374 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTAP01374 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTAP01374 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTAP01374 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTAP01374 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTAP01374 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTAP01374 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTAP01374 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTAP01374 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTAP01374 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTAP01374 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTAP01374 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTAP01374 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTAP01374 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTAP01374 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTAP01374 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTAP01374 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTAP01374 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTAP01374 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTAP01374 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTAP01374 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTAP01374 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTAP01374 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTAP01374 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTAP01374 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTAP01374 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTAP01374 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTAP01374 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTAP01374 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTAP01374 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTAP01374 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTAP01374 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTAP01374 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTAP01374 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTAP01374 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTAP01374 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTAP01374 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTAP01374 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTAP01374 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTAP01374 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTAP01374 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTAP01374 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTAP01374 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTAP01374 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTAP01374 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTAP01374 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTAP01374 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTAP01374 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTAP01374 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTAP01374 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTAP01374 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTAP01374 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTAP01374 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTAP01374 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTAP01374 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms