Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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