Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPIFP30405 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPIFP30405 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPIFP30405 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPIFP30405 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPIFP30405 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPIFP30405 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPIFP30405 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPIFP30405 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPIFP30405 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPIFP30405 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPIFP30405 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPIFP30405 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPIFP30405 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPIFP30405 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPIFP30405 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPIFP30405 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPIFP30405 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPIFP30405 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPIFP30405 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPIFP30405 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPIFP30405 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPIFP30405 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPIFP30405 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPIFP30405 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms