Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 OSBPL5-212ENST00000528124 567 ntTSL 428.8■■■□□ 2.27e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.191e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 RAC3-204ENST00000585014 798 ntTSL 228.69■■■□□ 2.181e-14■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-226ENST00000640813 1283 ntTSL 528.66■■■□□ 2.181e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 OSBPL5-206ENST00000471998 2182 ntTSL 228.64■■■□□ 2.187e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.177e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SARAF-205ENST00000518340 582 ntTSL 328.55■■■□□ 2.167e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SARAF-213ENST00000523761 566 ntTSL 428.55■■■□□ 2.167e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SARAF-203ENST00000518174 1981 ntTSL 528.52■■■□□ 2.167e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AL136531.2-201ENST00000618770 1164 ntTSL 228.38■■■□□ 2.137e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.117e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SARAF-207ENST00000521083 419 ntTSL 227.96■■■□□ 2.077e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.057e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.977e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP22-209ENST00000471013 690 ntTSL 327.19■■□□□ 1.947e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SARAF-206ENST00000520303 1803 ntTSL 1 (best)27.06■■□□□ 1.927e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 OTUD4-206ENST00000505976 671 ntTSL 526.99■■□□□ 1.911e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 CREBRF-202ENST00000517882 544 ntTSL 426.96■■□□□ 1.917e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.97e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.97e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 OSBPL5-215ENST00000533234 554 ntTSL 426.79■■□□□ 1.887e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-223ENST00000545901 581 ntTSL 1 (best)26.74■■□□□ 1.871e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.867e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.847e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.847e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.81e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.737e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.727e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.711e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.667e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.581e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STX1A-208ENST00000480126 724 ntTSL 524.93■■□□□ 1.587e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.561e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.557e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.557e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-225ENST00000546302 707 ntTSL 524.7■■□□□ 1.551e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-207ENST00000536185 441 ntTSL 324.7■■□□□ 1.551e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-222ENST00000545621 1282 ntTSL 1 (best)24.7■■□□□ 1.551e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.537e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.527e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.517e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STX1A-210ENST00000491427 710 ntTSL 224.48■■□□□ 1.517e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 LZTR1-216ENST00000495142 720 ntTSL 324.46■■□□□ 1.513e-8■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.477e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.477e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STX1A-213ENST00000496216 714 ntTSL 524.16■■□□□ 1.467e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP22-207ENST00000460425 2764 ntTSL 224.01■■□□□ 1.437e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 OSBPL5-219ENST00000534491 2224 ntTSL 1 (best)23.9■■□□□ 1.427e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.417e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-208ENST00000536813 507 ntTSL 323.88■■□□□ 1.411e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.411e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.387e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.331e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 LZTR1-210ENST00000464807 566 ntTSL 223.24■■□□□ 1.313e-8■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SMARCD1-211ENST00000551497 536 ntTSL 423.14■■□□□ 1.297e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.297e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AHSA1-204ENST00000554156 588 ntTSL 223.04■■□□□ 1.287e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 LZTR1-205ENST00000439171 635 ntTSL 523.04■■□□□ 1.283e-8■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GALNT10-208ENST00000520647 4359 ntTSL 222.89■■□□□ 1.267e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.227e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.227e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-210ENST00000488338 533 ntTSL 322.57■■□□□ 1.27e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.187e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 LZTR1-213ENST00000491432 527 ntTSL 322.4■■□□□ 1.183e-8■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.177e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SOD2-209ENST00000535561 551 ntTSL 322.3■■□□□ 1.167e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.167e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-211ENST00000490633 401 ntTSL 322.25■■□□□ 1.157e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.145e-20■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.17e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-224ENST00000546226 2112 ntTSL 221.84■■□□□ 1.091e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.087e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.067e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.067e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)21.56■■□□□ 1.047e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.037e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.027e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 WDR4-203ENST00000463902 609 ntTSL 321.38■■□□□ 1.017e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.987e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PHF19-212ENST00000478371 506 ntTSL 421.01■□□□□ 0.957e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SARAF-208ENST00000521265 1741 ntTSL 520.95■□□□□ 0.947e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.917e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.887e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 DNPH1-203ENST00000505042 396 ntTSL 220.56■□□□□ 0.887e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.877e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SYNGAP1-224ENST00000637721 190 ntTSL 520.37■□□□□ 0.857e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.757e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SOD2-204ENST00000401980 523 ntTSL 419.68■□□□□ 0.747e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-218ENST00000543821 562 ntTSL 419.64■□□□□ 0.731e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.717e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.681e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 FKBP1A-209ENST00000612074 409 ntTSL 219.18■□□□□ 0.667e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.657e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 OSBPL5-213ENST00000530372 575 ntTSL 419.05■□□□□ 0.647e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.597e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-205ENST00000535253 755 ntTSL 418.64■□□□□ 0.571e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-211ENST00000539986 1155 ntTSL 318.64■□□□□ 0.571e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 LZTR1-207ENST00000452988 878 ntTSL 318.64■□□□□ 0.573e-8■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SOD2-214ENST00000545162 571 ntTSL 318.45■□□□□ 0.547e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 MIR2110-201ENST00000459421 75 ntBASIC18.38■□□□□ 0.537e-6■■■□□ 16.5
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