Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PDE6HQ13956 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PDE6HQ13956 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PDE6HQ13956 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PDE6HQ13956 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PDE6HQ13956 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PDE6HQ13956 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PDE6HQ13956 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PDE6HQ13956 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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