Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms