RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343217.6

DUSP28-201, Transcript of dual specificity phosphatase 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene DUSP28, Length 1,555 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28-201ENST00000343217 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.2■■■■■ 5.47
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DUSP28-201ENST00000343217 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.72■■■■■ 4.27
DUSP28-201ENST00000343217 NACADO15069 1562 aa41.53■■■■■ 4.24
DUSP28-201ENST00000343217 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.23■■■■■ 4.19
DUSP28-201ENST00000343217 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.11■■■■■ 4.17
DUSP28-201ENST00000343217 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
DUSP28-201ENST00000343217 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.84■■■■■ 4.13
DUSP28-201ENST00000343217 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.7■■■■■ 4.11
DUSP28-201ENST00000343217 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.09
DUSP28-201ENST00000343217 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.63■■■■■ 4.09
DUSP28-201ENST00000343217 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.53■■■■■ 4.08
DUSP28-201ENST00000343217 SCRIBQ14160 1630 aa40.08■■■■■ 4.01
DUSP28-201ENST00000343217 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.03■■■■■ 4
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DUSP28-201ENST00000343217 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.47■■■■□ 3.91
DUSP28-201ENST00000343217 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.27■■■■□ 3.88
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DUSP28-201ENST00000343217 SMARCA2P51531 1590 aa38.17■■■■□ 3.7
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DUSP28-201ENST00000343217 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.9■■■■□ 3.66
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DUSP28-201ENST00000343217 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.42■■■■□ 3.58
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DUSP28-201ENST00000343217 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.16■■■■□ 3.54
DUSP28-201ENST00000343217 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.15■■■■□ 3.54
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DUSP28-201ENST00000343217 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.82■■■■□ 3.49
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DUSP28-201ENST00000343217 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.74■■■■□ 3.47
DUSP28-201ENST00000343217 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.73■■■■□ 3.47
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DUSP28-201ENST00000343217 PRDM2Q13029 1718 aa36.55■■■■□ 3.44
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DUSP28-201ENST00000343217 ABCC8Q09428 1581 aa36.04■■■■□ 3.36
DUSP28-201ENST00000343217 IFT140Q96RY7 1462 aa36■■■■□ 3.35
DUSP28-201ENST00000343217 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36■■■■□ 3.35
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DUSP28-201ENST00000343217 TRIM41Q8WV44 630 aa35.51■■■■□ 3.27
DUSP28-201ENST00000343217 WDR97A6NE52 1622 aa35.45■■■■□ 3.27
DUSP28-201ENST00000343217 CHD1O14646 1710 aa35.43■■■■□ 3.26
DUSP28-201ENST00000343217 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
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DUSP28-201ENST00000343217 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.34■■■■□ 3.25
DUSP28-201ENST00000343217 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.34■■■■□ 3.25
DUSP28-201ENST00000343217 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.27■■■■□ 3.24
DUSP28-201ENST00000343217 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.26■■■■□ 3.24
DUSP28-201ENST00000343217 ARHGEF11O15085 1522 aa35.26■■■■□ 3.23
DUSP28-201ENST00000343217 FBLN2P98095 1184 aa35.23■■■■□ 3.23
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DUSP28-201ENST00000343217 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.14■■■■□ 3.22
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DUSP28-201ENST00000343217 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.12■■■■□ 3.21
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DUSP28-201ENST00000343217 NUP160Q12769 1436 aa34.67■■■■□ 3.14
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DUSP28-201ENST00000343217 SHROOM2Q13796 1616 aa34.51■■■■□ 3.11
DUSP28-201ENST00000343217 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.49■■■■□ 3.11
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DUSP28-201ENST00000343217 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
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DUSP28-201ENST00000343217 CUL7Q14999 1698 aa34.33■■■■□ 3.09
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