Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB5BP61020 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB5BP61020 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB5BP61020 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB5BP61020 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB5BP61020 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB5BP61020 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB5BP61020 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB5BP61020 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB5BP61020 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB5BP61020 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB5BP61020 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB5BP61020 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB5BP61020 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB5BP61020 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB5BP61020 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB5BP61020 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB5BP61020 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB5BP61020 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB5BP61020 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB5BP61020 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB5BP61020 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB5BP61020 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB5BP61020 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB5BP61020 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB5BP61020 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB5BP61020 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB5BP61020 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB5BP61020 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB5BP61020 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB5BP61020 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB5BP61020 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB5BP61020 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB5BP61020 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB5BP61020 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB5BP61020 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB5BP61020 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB5BP61020 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB5BP61020 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB5BP61020 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB5BP61020 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB5BP61020 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB5BP61020 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB5BP61020 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB5BP61020 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB5BP61020 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB5BP61020 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB5BP61020 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB5BP61020 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB5BP61020 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB5BP61020 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB5BP61020 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB5BP61020 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB5BP61020 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB5BP61020 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB5BP61020 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB5BP61020 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB5BP61020 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB5BP61020 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB5BP61020 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB5BP61020 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB5BP61020 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB5BP61020 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB5BP61020 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB5BP61020 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB5BP61020 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB5BP61020 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB5BP61020 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB5BP61020 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB5BP61020 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB5BP61020 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB5BP61020 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB5BP61020 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB5BP61020 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB5BP61020 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB5BP61020 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB5BP61020 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB5BP61020 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB5BP61020 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB5BP61020 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB5BP61020 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB5BP61020 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB5BP61020 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB5BP61020 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB5BP61020 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB5BP61020 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB5BP61020 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB5BP61020 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB5BP61020 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB5BP61020 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB5BP61020 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB5BP61020 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB5BP61020 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB5BP61020 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB5BP61020 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB5BP61020 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB5BP61020 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB5BP61020 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB5BP61020 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB5BP61020 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms