Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUBP2Q9Y5Y2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NUBP2Q9Y5Y2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUBP2Q9Y5Y2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms