Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C1

NOP16, Nucleolar protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP16Q9Y3C1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP16Q9Y3C1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP16Q9Y3C1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms