Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3LQ9Y262 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3LQ9Y262 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EIF3LQ9Y262 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms