Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HPSEQ9Y251 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HPSEQ9Y251 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HPSEQ9Y251 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HPSEQ9Y251 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HPSEQ9Y251 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HPSEQ9Y251 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HPSEQ9Y251 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HPSEQ9Y251 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPSEQ9Y251 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPSEQ9Y251 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.4 ms