Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HPSEQ9Y251 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
HPSEQ9Y251 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
HPSEQ9Y251 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HPSEQ9Y251 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HPSEQ9Y251 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HPSEQ9Y251 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
HPSEQ9Y251 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HPSEQ9Y251 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HPSEQ9Y251 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HPSEQ9Y251 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
HPSEQ9Y251 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HPSEQ9Y251 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HPSEQ9Y251 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
HPSEQ9Y251 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HPSEQ9Y251 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HPSEQ9Y251 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HPSEQ9Y251 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HPSEQ9Y251 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HPSEQ9Y251 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HPSEQ9Y251 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
HPSEQ9Y251 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HPSEQ9Y251 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HPSEQ9Y251 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HPSEQ9Y251 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
HPSEQ9Y251 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
HPSEQ9Y251 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HPSEQ9Y251 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HPSEQ9Y251 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HPSEQ9Y251 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HPSEQ9Y251 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HPSEQ9Y251 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HPSEQ9Y251 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HPSEQ9Y251 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HPSEQ9Y251 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HPSEQ9Y251 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HPSEQ9Y251 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HPSEQ9Y251 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HPSEQ9Y251 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HPSEQ9Y251 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HPSEQ9Y251 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HPSEQ9Y251 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HPSEQ9Y251 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HPSEQ9Y251 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HPSEQ9Y251 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HPSEQ9Y251 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HPSEQ9Y251 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HPSEQ9Y251 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HPSEQ9Y251 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HPSEQ9Y251 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HPSEQ9Y251 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HPSEQ9Y251 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HPSEQ9Y251 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HPSEQ9Y251 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HPSEQ9Y251 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HPSEQ9Y251 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HPSEQ9Y251 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HPSEQ9Y251 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HPSEQ9Y251 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HPSEQ9Y251 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HPSEQ9Y251 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HPSEQ9Y251 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HPSEQ9Y251 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HPSEQ9Y251 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HPSEQ9Y251 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HPSEQ9Y251 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HPSEQ9Y251 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HPSEQ9Y251 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HPSEQ9Y251 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HPSEQ9Y251 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HPSEQ9Y251 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HPSEQ9Y251 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HPSEQ9Y251 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HPSEQ9Y251 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HPSEQ9Y251 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
HPSEQ9Y251 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HPSEQ9Y251 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HPSEQ9Y251 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HPSEQ9Y251 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HPSEQ9Y251 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HPSEQ9Y251 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HPSEQ9Y251 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
HPSEQ9Y251 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HPSEQ9Y251 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HPSEQ9Y251 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HPSEQ9Y251 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
HPSEQ9Y251 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HPSEQ9Y251 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HPSEQ9Y251 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HPSEQ9Y251 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HPSEQ9Y251 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HPSEQ9Y251 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
HPSEQ9Y251 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HPSEQ9Y251 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HPSEQ9Y251 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HPSEQ9Y251 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HPSEQ9Y251 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HPSEQ9Y251 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HPSEQ9Y251 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HPSEQ9Y251 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms