Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNRC6BQ9UPQ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6BQ9UPQ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNRC6BQ9UPQ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6BQ9UPQ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6BQ9UPQ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms