Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT3LQ9UJW3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT3LQ9UJW3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT3LQ9UJW3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT3LQ9UJW3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT3LQ9UJW3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT3LQ9UJW3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DNMT3LQ9UJW3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3LQ9UJW3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNMT3LQ9UJW3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT3LQ9UJW3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms