Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLCO3A1Q9UIG8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLCO3A1Q9UIG8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLCO3A1Q9UIG8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLCO3A1Q9UIG8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLCO3A1Q9UIG8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLCO3A1Q9UIG8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLCO3A1Q9UIG8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLCO3A1Q9UIG8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLCO3A1Q9UIG8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLCO3A1Q9UIG8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms