Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MGAT4CQ9UBM8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4CQ9UBM8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT4CQ9UBM8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms