Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SAE1Q9UBE0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAE1Q9UBE0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAE1Q9UBE0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAE1Q9UBE0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms