Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFY2Q9P0M6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFY2Q9P0M6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms