Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TVP23BQ9NYZ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TVP23BQ9NYZ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms