Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU7

SDAD1, Protein SDA1 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDAD1Q9NVU7 FAM193B-219ENST00000524677 1916 ntTSL 217.94■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 SH3TC1-214ENST00000508183 1410 ntTSL 1 (best)17.3■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 FAM193B-204ENST00000505569 1870 ntTSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 NDUFS2-209ENST00000479948 681 ntTSL 316.91■□□□□ 0.33e-13■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 FAM193B-212ENST00000510163 2237 ntTSL 1 (best)16.78■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-212ENST00000563441 2664 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-234ENST00000566634 1540 ntTSL 515.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MPRIP-219ENST00000584067 3195 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-226ENST00000565784 571 ntTSL 415.41■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-214ENST00000563539 659 ntTSL 415.38■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-202ENST00000421803 1111 ntTSL 215.38■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-237ENST00000568374 569 ntTSL 415.38■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 ACTR3-204ENST00000446821 818 ntTSL 315.31■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-206ENST00000562071 602 ntTSL 314.85□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 SH3TC1-223ENST00000513495 600 ntTSL 414.73□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-232ENST00000566256 580 ntTSL 414.61□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 SH3TC1-220ENST00000511002 1124 ntTSL 514.37□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 SH3TC1-204ENST00000502350 2258 ntTSL 214.32□□□□□ -0.124e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 SH3TC1-205ENST00000502559 3798 ntTSL 214.06□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 SREBF2-205ENST00000463741 634 ntTSL 213.85□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-241ENST00000569355 867 ntTSL 513.8□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 SH3TC1-212ENST00000507801 538 ntTSL 413.75□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-222ENST00000565534 1002 ntTSL 213.44□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-243ENST00000570257 992 ntTSL 513.19□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 ERN1-206ENST00000583896 571 ntTSL 512.96□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 FAM118A-211ENST00000477714 756 ntTSL 212.63□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MAN2C1-225ENST00000565699 556 ntTSL 312.18□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 ACTR3-203ENST00000443297 566 ntTSL 412.1□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 HDAC6-227ENST00000485102 667 ntTSL 311.98□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 HDAC6-228ENST00000486227 4718 ntTSL 211.84□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 UBR4-213ENST00000483922 543 ntTSL 511.7□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 FNBP1L-202ENST00000271234 4212 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 ACTR3-202ENST00000415792 676 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 FNBP1L-201ENST00000260506 5341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-222ENST00000474842 1091 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.754e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 NPHP3-203ENST00000465756 3852 ntTSL 510.28□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 HDAC6-222ENST00000478095 620 ntTSL 49.52□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 FNBP1L-204ENST00000424449 1518 ntTSL 29.5□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 S100P-201ENST00000296370 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 MPRIP-215ENST00000579832 438 ntTSL 39.16□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-221ENST00000470664 704 ntTSL 38.71□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 NPHP3-204ENST00000469232 1616 ntTSL 27.64□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 S100P-202ENST00000513778 313 ntTSL 34.8□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.774e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 NPHP3-205ENST00000471145 435 ntTSL 53.61□□□□□ -1.834e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 ACTR3-207ENST00000489779 545 ntTSL 23.56□□□□□ -1.844e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.914e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 RECQL4-202ENST00000524998 686 ntTSL 318.27■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 KDM5C-201ENST00000349663 548 ntTSL 417■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 KDM5C-207ENST00000429877 870 ntTSL 316.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 KDM5C-206ENST00000428012 766 ntTSL 312.79□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 44
SDAD1Q9NVU7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 43.8
SDAD1Q9NVU7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 43.8
SDAD1Q9NVU7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 ZSWIM8-205ENST00000433366 5773 ntTSL 518.56■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 ZSWIM8-204ENST00000431225 1687 ntTSL 516.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 ZSWIM8-212ENST00000492395 4490 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-203ENST00000563367 891 ntTSL 326.18■■□□□ 1.782e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-209ENST00000566600 913 ntTSL 224.36■■□□□ 1.492e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-208ENST00000565379 911 ntTSL 224.16■■□□□ 1.462e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-202ENST00000561637 1014 ntTSL 223.25■■□□□ 1.312e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-206ENST00000564252 599 ntTSL 222.01■■□□□ 1.112e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-210ENST00000567271 752 ntTSL 220.08■□□□□ 0.812e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-207ENST00000564628 811 ntTSL 517.45■□□□□ 0.382e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-205ENST00000563854 583 ntTSL 516.35■□□□□ 0.212e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 NME3-211ENST00000568561 813 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 42.6
SDAD1Q9NVU7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.126e-7■■■■■ 42.5
SDAD1Q9NVU7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.676e-7■■■■■ 42.5
SDAD1Q9NVU7 AJUBA-207ENST00000555479 558 ntTSL 410.73□□□□□ -0.692e-12■■■■■ 41.8
SDAD1Q9NVU7 RECQL4-205ENST00000532846 1055 ntTSL 516.1■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 41.7
SDAD1Q9NVU7 PTPRF-212ENST00000477970 3321 ntTSL 212.4□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 41.4
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.718e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.658e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-204ENST00000525592 882 ntTSL 318.59■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 40.9
Retrieved 100 of 11,671 protein–RNA pairs in 268.6 ms