Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A9Q9NUM3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A9Q9NUM3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A9Q9NUM3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms