Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJB4Q9NTQ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJB4Q9NTQ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJB4Q9NTQ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJB4Q9NTQ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB4Q9NTQ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms