Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
GJB4Q9NTQ9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
GJB4Q9NTQ9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
GJB4Q9NTQ9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GJB4Q9NTQ9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
GJB4Q9NTQ9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
GJB4Q9NTQ9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GJB4Q9NTQ9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
GJB4Q9NTQ9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
GJB4Q9NTQ9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GJB4Q9NTQ9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GJB4Q9NTQ9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
GJB4Q9NTQ9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GJB4Q9NTQ9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GJB4Q9NTQ9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
GJB4Q9NTQ9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GJB4Q9NTQ9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GJB4Q9NTQ9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GJB4Q9NTQ9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GJB4Q9NTQ9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GJB4Q9NTQ9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GJB4Q9NTQ9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GJB4Q9NTQ9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GJB4Q9NTQ9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GJB4Q9NTQ9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
GJB4Q9NTQ9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GJB4Q9NTQ9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GJB4Q9NTQ9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GJB4Q9NTQ9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GJB4Q9NTQ9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GJB4Q9NTQ9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GJB4Q9NTQ9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GJB4Q9NTQ9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GJB4Q9NTQ9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GJB4Q9NTQ9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GJB4Q9NTQ9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GJB4Q9NTQ9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GJB4Q9NTQ9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
GJB4Q9NTQ9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GJB4Q9NTQ9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GJB4Q9NTQ9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GJB4Q9NTQ9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJB4Q9NTQ9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJB4Q9NTQ9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJB4Q9NTQ9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GJB4Q9NTQ9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GJB4Q9NTQ9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GJB4Q9NTQ9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GJB4Q9NTQ9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GJB4Q9NTQ9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GJB4Q9NTQ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GJB4Q9NTQ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GJB4Q9NTQ9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GJB4Q9NTQ9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GJB4Q9NTQ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GJB4Q9NTQ9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GJB4Q9NTQ9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GJB4Q9NTQ9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GJB4Q9NTQ9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GJB4Q9NTQ9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GJB4Q9NTQ9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GJB4Q9NTQ9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GJB4Q9NTQ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
GJB4Q9NTQ9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GJB4Q9NTQ9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GJB4Q9NTQ9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GJB4Q9NTQ9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GJB4Q9NTQ9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GJB4Q9NTQ9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GJB4Q9NTQ9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GJB4Q9NTQ9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GJB4Q9NTQ9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GJB4Q9NTQ9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GJB4Q9NTQ9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GJB4Q9NTQ9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GJB4Q9NTQ9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GJB4Q9NTQ9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GJB4Q9NTQ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GJB4Q9NTQ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GJB4Q9NTQ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
GJB4Q9NTQ9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GJB4Q9NTQ9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GJB4Q9NTQ9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
GJB4Q9NTQ9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GJB4Q9NTQ9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GJB4Q9NTQ9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GJB4Q9NTQ9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GJB4Q9NTQ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GJB4Q9NTQ9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GJB4Q9NTQ9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJB4Q9NTQ9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
GJB4Q9NTQ9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GJB4Q9NTQ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GJB4Q9NTQ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
GJB4Q9NTQ9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GJB4Q9NTQ9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GJB4Q9NTQ9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GJB4Q9NTQ9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GJB4Q9NTQ9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GJB4Q9NTQ9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms